Zentrales Anliegen der Horizon Europe Programmsäule „Innovatives Europa“ ist es, die Wettbewerbsfähigkeit der EU entscheidend zu stärken, indem es europäische Innovatoren, Startups und KMU dabei unterstützt, bahnbrechende Ideen in marktbeherrschende Innovationen zu verwandeln. Auf diese Weise sollen die Abwanderung innovativer Unternehmen verhindert und die Investitionen in marktschaffende Innovationen in Europa deutlich gesteigert werden.
Als zentrales Organ der Programmsäule Innovatives Europa fungiert der Europäischen Innovationsrat (European Innovation Council, EIC). Seine Rolle ist es, mit einem Bündel an Modellen die Finanzierungslücken zu schließen, die sich für europäische KMU und Startups mit vielversprechenden, aber riskanten Innovationsprojekten in der Vergangenheit immer wieder aufgetan haben.
Ergänzt wird der EIC durch die Europäischen Innovationssysteme (European Innovation Ecosystems (EIE)) zur besseren Vernetzung der nationalen Innovationsysteme.
Zudem fördert das Europäische Innovations- und Technologieinstitut (EIT) die Integration von Unternehmen, Forschung, Hochschulbildung und Unternehmertum.