Die Einreichkriterien sind in den Ausschreibungsdokumenten der Europäischen Kommission beschrieben.
Forschungs- und Innovationsmaßnahmen (RIA) sowie Innovationsmaßnahmen (IA) müssen grundsätzlich aus einem Konsortium mit mindestens drei voneinander unabhängigen Organisationen bestehen, wovon mindestens eine den Sitz in einem EU-Mitgliedstaat haben muss.
Horizon Europe ist offen für Hochschulen, Forschungseinrichtungen, Unternehmen, internationale Organisationen und andere Rechtspersonen aus EU-Mitgliedstaaten sowie assoziierten Ländern. Auch Einrichtungen aus Drittstaaten können grundsätzlich teilnehmen, sind aber nicht zwingend förderberechtigt.